More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3407 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  63.74 
 
 
609 aa  696    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  59.07 
 
 
613 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  90.08 
 
 
625 aa  1016    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  60.34 
 
 
602 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  100 
 
 
625 aa  1202    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  61.03 
 
 
608 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  60.64 
 
 
591 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  55.85 
 
 
671 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  57.24 
 
 
597 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  54.77 
 
 
726 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  53.22 
 
 
589 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  54.01 
 
 
638 aa  544  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  52.33 
 
 
610 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.83 
 
 
617 aa  508  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  50.33 
 
 
635 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.39 
 
 
730 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  50.76 
 
 
608 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  47.46 
 
 
605 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.57 
 
 
606 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  44.5 
 
 
584 aa  438  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  42.24 
 
 
984 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.43 
 
 
581 aa  267  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  35.88 
 
 
641 aa  263  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.41 
 
 
622 aa  263  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.83 
 
 
636 aa  261  4e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.31 
 
 
1284 aa  258  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  34.55 
 
 
636 aa  258  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.57 
 
 
579 aa  257  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  37.22 
 
 
663 aa  257  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  33.39 
 
 
638 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  34.59 
 
 
650 aa  256  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  34.59 
 
 
650 aa  256  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.17 
 
 
587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  29.03 
 
 
594 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
628 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.9 
 
 
585 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  38.54 
 
 
654 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.65 
 
 
614 aa  254  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34.97 
 
 
641 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  30.12 
 
 
606 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  35.03 
 
 
622 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.3 
 
 
627 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  37.65 
 
 
620 aa  253  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.12 
 
 
571 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.12 
 
 
571 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.12 
 
 
571 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.12 
 
 
571 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.12 
 
 
571 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.12 
 
 
571 aa  253  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  35.37 
 
 
631 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  29.57 
 
 
585 aa  251  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.94 
 
 
571 aa  251  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  28.77 
 
 
571 aa  250  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  34.56 
 
 
627 aa  250  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  31.32 
 
 
604 aa  250  6e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.67 
 
 
571 aa  249  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  31.31 
 
 
604 aa  249  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.34 
 
 
575 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.77 
 
 
602 aa  249  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.94 
 
 
571 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  34.49 
 
 
633 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  41.56 
 
 
1231 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  34.54 
 
 
659 aa  248  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.51 
 
 
589 aa  248  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  35.63 
 
 
638 aa  247  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  29.05 
 
 
587 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  35.33 
 
 
1522 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  28.04 
 
 
588 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  31.2 
 
 
586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.94 
 
 
573 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.86 
 
 
577 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.01 
 
 
1257 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.6 
 
 
586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  29.9 
 
 
583 aa  244  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  35.26 
 
 
642 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  29.3 
 
 
596 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  30.84 
 
 
583 aa  244  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  36.03 
 
 
624 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  37.57 
 
 
632 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
604 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  34 
 
 
578 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  29 
 
 
598 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.52 
 
 
636 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  33.4 
 
 
576 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  32.61 
 
 
639 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  34.83 
 
 
634 aa  242  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  28.96 
 
 
589 aa  242  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  36.01 
 
 
640 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  30.03 
 
 
591 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  27.23 
 
 
585 aa  241  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  33.57 
 
 
578 aa  241  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  30.82 
 
 
578 aa  240  6.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
596 aa  240  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  35.58 
 
 
640 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.76 
 
 
572 aa  239  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  31.31 
 
 
616 aa  239  9e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  31.88 
 
 
644 aa  238  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  30.05 
 
 
609 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  31.37 
 
 
588 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  34.95 
 
 
658 aa  237  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>