More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2568 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  100 
 
 
426 aa  821    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  84.91 
 
 
426 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  57.82 
 
 
437 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  54.52 
 
 
442 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  48.75 
 
 
420 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  47.21 
 
 
424 aa  346  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  48.62 
 
 
420 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  47.12 
 
 
422 aa  338  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  52.72 
 
 
419 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  43.89 
 
 
1270 aa  330  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  45.69 
 
 
431 aa  330  4e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  48.08 
 
 
422 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  48.08 
 
 
422 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  48.08 
 
 
422 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  48.51 
 
 
575 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  41.69 
 
 
443 aa  319  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  48.12 
 
 
421 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  41.88 
 
 
471 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  40.44 
 
 
421 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  41.62 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  46.62 
 
 
653 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  44.86 
 
 
417 aa  310  5e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  40.6 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  48.15 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  39.16 
 
 
425 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  47.13 
 
 
420 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  45.76 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  46.72 
 
 
416 aa  302  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  40 
 
 
446 aa  299  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  44.68 
 
 
444 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  48.11 
 
 
405 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  43.21 
 
 
438 aa  293  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  39.51 
 
 
446 aa  292  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  41.34 
 
 
438 aa  292  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  43.14 
 
 
437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  41.79 
 
 
419 aa  286  5e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  40.19 
 
 
445 aa  285  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  42.71 
 
 
453 aa  285  8e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  39.36 
 
 
441 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  45.68 
 
 
427 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  37.65 
 
 
447 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  41.61 
 
 
430 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  43.18 
 
 
428 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  41.5 
 
 
430 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  40.95 
 
 
367 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  38.38 
 
 
410 aa  268  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  40 
 
 
396 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  42.53 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  41.5 
 
 
389 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  40.99 
 
 
387 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  39.13 
 
 
388 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  40.7 
 
 
387 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  35.59 
 
 
439 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  41.02 
 
 
387 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  40.41 
 
 
387 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  40.12 
 
 
387 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  40.12 
 
 
387 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  38.55 
 
 
389 aa  206  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  39 
 
 
390 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.99 
 
 
438 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  38.08 
 
 
399 aa  203  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  40.7 
 
 
387 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  40.12 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  39 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  41.25 
 
 
425 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  40.11 
 
 
393 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  37.14 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  38.55 
 
 
384 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  41.67 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  37.08 
 
 
403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  38.81 
 
 
393 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  40.06 
 
 
398 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  39.14 
 
 
398 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  35.07 
 
 
392 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  35.41 
 
 
465 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  32.35 
 
 
390 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  36.61 
 
 
399 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  35.16 
 
 
465 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  38.68 
 
 
412 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  35.49 
 
 
379 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  34.62 
 
 
405 aa  193  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  40.11 
 
 
389 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  40.34 
 
 
390 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  38.74 
 
 
393 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 
391 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  35.41 
 
 
399 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  32 
 
 
393 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  39.18 
 
 
389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  32.14 
 
 
431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  34.91 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  38.31 
 
 
384 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  31.98 
 
 
400 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  34.77 
 
 
407 aa  189  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  37.38 
 
 
400 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  33.58 
 
 
404 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  34.93 
 
 
385 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  34.66 
 
 
435 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  37.64 
 
 
399 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  38.73 
 
 
394 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  38.44 
 
 
394 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>