More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0614 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  76.1 
 
 		 181 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  76.1 
 
 		 181 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  76.1 
 
 		 181 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  76.1 
 
 		 181 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  76.1 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  76.1 
 
 		 181 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  76.1 
 
 		 181 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  75.47 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  63.35 
 
 		 179 aa  218  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  82.68 
 
 		 150 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  64.15 
 
 		 178 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  54.95 
 
 		 183 aa  205  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  61.54 
 
 		 197 aa  198  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  55.56 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  48.43 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  43.24 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  39.74 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  35.71 
 
 		 176 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  39.04 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  34.55 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  30.77 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.14 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  36.44 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 307 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  26 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  26 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 269 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  35.4 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  34.62 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  34.07 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  30.92 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  33.15 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  33.52 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  26.86 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  25.71 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.2 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.2 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0105  hypothetical protein  51.85 
 
 		 61 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  40.45 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  28.48 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  31.11 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  32.12 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.37 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0426  MscS mechanosensitive ion channel  30.87 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000444789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  37.04 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  24.44 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  25.49 
 
 		 288 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 400 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  37.04 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1557  mechanosensitive ion channel family protein  27.15 
 
 		 274 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172425  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 276 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  26 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  26 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  26 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  26 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  26 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  26 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  25.32 
 
 		 351 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  25.66 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  26 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 298 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  38.64 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  26 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  26 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.74 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 		 283 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  23.46 
 
 		 274 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 262 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 275 aa  52  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  23.62 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 283 aa  52  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1616  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 273 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.19083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.71 
 
 		 364 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  24.68 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  27.17 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 302 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 414 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.22 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  23.9 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>