More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2356 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 173 aa  347  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  53.29 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  49.36 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 184 aa  98.2  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  34.32 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 154 aa  97.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  38.75 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 169 aa  94  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  41.13 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  33.97 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 170 aa  91.3  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 170 aa  90.9  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 154 aa  90.9  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  36.36 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  37.65 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.44 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.98 
 
 		 169 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 172 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 173 aa  87.4  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.98 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  39.51 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  32.34 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.75 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  41.84 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 		 235 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  35.57 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  31.68 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 178 aa  84.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 154 aa  84  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 168 aa  84  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>