More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0075 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 350 aa  715    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  68.68 
 
 		 343 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  68.1 
 
 		 343 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  67.75 
 
 		 349 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  64.24 
 
 		 344 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  69.75 
 
 		 340 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  64.27 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  63.69 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  63.03 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  63.47 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  64.93 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  63.04 
 
 		 347 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  62.9 
 
 		 341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  62.82 
 
 		 349 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  64.57 
 
 		 341 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  61.49 
 
 		 350 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  69.31 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  66.25 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  62.36 
 
 		 352 aa  437  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  61.93 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  63.05 
 
 		 354 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  64.9 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  68.67 
 
 		 350 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  64.39 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  66.09 
 
 		 347 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  64.1 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  64.1 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  67.55 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  68.33 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  62.31 
 
 		 345 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  63.77 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  63.48 
 
 		 346 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  59.83 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  60.65 
 
 		 346 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  67.47 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  55.87 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  62.71 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  59.36 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  52.72 
 
 		 364 aa  359  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  58.76 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  59.18 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  53.06 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  53.4 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  51.72 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  51.03 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  53.1 
 
 		 305 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  52.36 
 
 		 296 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  48.41 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  47.93 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  47.95 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  41.87 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  41.7 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  39.86 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  39.86 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  39.86 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  39.86 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  39.86 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  39.86 
 
 		 298 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  39.86 
 
 		 298 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 		 306 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 310 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 310 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  40.85 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  38.16 
 
 		 296 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  40.64 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  40.49 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 293 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 287 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  29.36 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  42.99 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  25.34 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  40.5 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1116  alpha/beta hydrolase  42.86 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.5 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  29.26 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>