More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0906 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0906  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 209 aa  426  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00296617  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0948  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  76.08 
 
 		 209 aa  335  2.9999999999999997e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0793673  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0359  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.98 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000171313  hitchhiker  0.000153008 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  51.67 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0577  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.78 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.93 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1533  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0016393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  44.44 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  44.29 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1326  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00202855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  46.67 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  44.61 
 
 		 251 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 240 aa  197  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 		 594 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  44.76 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  42.45 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 		 594 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6258  ABC transporter related  45.58 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000084841  normal  0.418068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  45.07 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1666  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.31 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  46.38 
 
 		 258 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 242 aa  194  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  43.81 
 
 		 247 aa  194  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 240 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4838  ABC transporter related  46.05 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322693  normal  0.0389371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  44.55 
 
 		 268 aa  194  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  44.29 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  44.29 
 
 		 241 aa  193  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 249 aa  193  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  43.69 
 
 		 244 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  44.29 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  42.58 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  44.29 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.96 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  44.93 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  46.45 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.12 
 
 		 619 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  44.29 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.38 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.38 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  42.92 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 		 242 aa  191  6e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  43 
 
 		 250 aa  191  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 240 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  42.58 
 
 		 244 aa  191  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  42.45 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.15 
 
 		 242 aa  191  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  43.54 
 
 		 247 aa  191  9e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  43.54 
 
 		 254 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.33 
 
 		 592 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  49.28 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  45.71 
 
 		 243 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  43.54 
 
 		 254 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 244 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  46.86 
 
 		 242 aa  190  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  43.87 
 
 		 271 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  46.6 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 261 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  42.38 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  43.06 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  43.4 
 
 		 242 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.66 
 
 		 597 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  45.71 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4774  ABC transporter related  41.51 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0204  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.701946  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  45.71 
 
 		 243 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  43.54 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>