124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3513 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  100 
 
 		 507 aa  1060    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  85.8 
 
 		 507 aa  911    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  61.42 
 
 		 508 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  62.4 
 
 		 508 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  72.19 
 
 		 507 aa  771    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  58.89 
 
 		 508 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  55.65 
 
 		 507 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  55.43 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  51.6 
 
 		 511 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  54.98 
 
 		 515 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  51.6 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  48.4 
 
 		 537 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  45.49 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  45.49 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  45.29 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  44.89 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  42.26 
 
 		 517 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  42.61 
 
 		 526 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  42.72 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  42.69 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  43.35 
 
 		 522 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  42.83 
 
 		 524 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  40.71 
 
 		 537 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  39.88 
 
 		 524 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  40.2 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  40.12 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  38.51 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  41.67 
 
 		 527 aa  379  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  39.53 
 
 		 532 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  40.31 
 
 		 520 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  39.04 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  38.61 
 
 		 525 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  39.5 
 
 		 528 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  39.72 
 
 		 505 aa  363  3e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  39.17 
 
 		 531 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  37.98 
 
 		 520 aa  355  8.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  37.43 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  37.31 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  37.31 
 
 		 543 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  37.31 
 
 		 543 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  38.06 
 
 		 522 aa  342  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  36.75 
 
 		 543 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31.89 
 
 		 505 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  31.89 
 
 		 508 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.5 
 
 		 508 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.06 
 
 		 529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.06 
 
 		 529 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 507 aa  252  9.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  34.26 
 
 		 538 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  34.26 
 
 		 538 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  34.26 
 
 		 538 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 511 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  33.48 
 
 		 538 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  33.48 
 
 		 538 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.77 
 
 		 497 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 538 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  34.04 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  34.53 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  33.98 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 507 aa  240  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  32.95 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.07 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 499 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  33.69 
 
 		 537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 499 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  33.83 
 
 		 512 aa  233  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  32.37 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.67 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  31.49 
 
 		 502 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  31.36 
 
 		 492 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 506 aa  230  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  32.17 
 
 		 503 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  31.65 
 
 		 497 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  32.08 
 
 		 523 aa  229  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  32.05 
 
 		 498 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  34.7 
 
 		 515 aa  226  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 494 aa  226  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  31.54 
 
 		 496 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  31.2 
 
 		 740 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  35.44 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.1 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  30.38 
 
 		 500 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 501 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  33.76 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 497 aa  220  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  30.6 
 
 		 505 aa  219  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  31.26 
 
 		 506 aa  219  8.999999999999998e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  29.53 
 
 		 496 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 510 aa  219  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  31.79 
 
 		 510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  31.16 
 
 		 495 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  34.19 
 
 		 501 aa  217  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  33.01 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  32.14 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  30.53 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  30.53 
 
 		 504 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 497 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>