More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2862 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  100 
 
 		 401 aa  823    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  84.54 
 
 		 401 aa  693    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  89.53 
 
 		 401 aa  720    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  89.53 
 
 		 401 aa  728    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  86.53 
 
 		 401 aa  705    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  86.28 
 
 		 401 aa  703    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  89.28 
 
 		 401 aa  734    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  86.53 
 
 		 401 aa  705    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  82.59 
 
 		 402 aa  692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  64.41 
 
 		 401 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  62.25 
 
 		 404 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  61.85 
 
 		 407 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  55.94 
 
 		 404 aa  474  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  57.53 
 
 		 406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  59.1 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  56.33 
 
 		 398 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  32.93 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 421 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  31.46 
 
 		 416 aa  222  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  32.36 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  32.53 
 
 		 421 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  31.5 
 
 		 426 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  30.81 
 
 		 420 aa  206  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  30.24 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  25.3 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  28.36 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  27.38 
 
 		 413 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  29.43 
 
 		 409 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  27.5 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 448 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 		 395 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  26.45 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 466 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  26.69 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  24.48 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  25.68 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  23.42 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  28 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  27.35 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  25.15 
 
 		 419 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 429 aa  109  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4158  metal dependent phosphohydrolase  26.81 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  29.53 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  24.55 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1725  metal dependent phosphohydrolase  42.54 
 
 		 207 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.01 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>