157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0967 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  100 
 
 		 172 aa  358  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  94.19 
 
 		 245 aa  342  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  93.6 
 
 		 245 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  93.6 
 
 		 245 aa  340  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  88.37 
 
 		 245 aa  326  8e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  88.37 
 
 		 245 aa  326  8e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  88.37 
 
 		 245 aa  326  8e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  88.37 
 
 		 245 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  88.95 
 
 		 245 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  81.87 
 
 		 245 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  80.23 
 
 		 245 aa  295  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  79.65 
 
 		 245 aa  294  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  77.91 
 
 		 245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  76.16 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  74.85 
 
 		 245 aa  281  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  72.09 
 
 		 247 aa  275  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  72.09 
 
 		 245 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  71.93 
 
 		 245 aa  264  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  70.18 
 
 		 245 aa  260  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  68.02 
 
 		 244 aa  254  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  56.4 
 
 		 244 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  51.46 
 
 		 248 aa  179  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  45.22 
 
 		 245 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  42.2 
 
 		 246 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  42.2 
 
 		 246 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  38.95 
 
 		 248 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  41.4 
 
 		 246 aa  141  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  40.46 
 
 		 250 aa  141  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  37.85 
 
 		 269 aa  140  7e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  39.26 
 
 		 289 aa  127  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  37.5 
 
 		 275 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  39.24 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  34.9 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.77 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 		 408 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  34 
 
 		 415 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  33.11 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  33.11 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  33.11 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  33.11 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  32.82 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  26.51 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  35.61 
 
 		 433 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  33.11 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  33.8 
 
 		 410 aa  64.3  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.65 
 
 		 251 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  34.18 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  32.67 
 
 		 409 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  28.95 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.91 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  32.45 
 
 		 230 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  30 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  31.17 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  34.29 
 
 		 415 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 409 aa  60.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  27.06 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  33.57 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  33.57 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  35.77 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  28.97 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  28.19 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  36.29 
 
 		 413 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.59 
 
 		 248 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.82 
 
 		 247 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  36.8 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  28.79 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  26.62 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  27.52 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  29.52 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 407 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  29.2 
 
 		 232 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 		 407 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  30.37 
 
 		 257 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  32.58 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  25.5 
 
 		 276 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.45 
 
 		 291 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  33.56 
 
 		 248 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 261 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  29.8 
 
 		 230 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  29.8 
 
 		 230 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  29.8 
 
 		 230 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  29.8 
 
 		 230 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  29.8 
 
 		 230 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  29.8 
 
 		 230 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  29.8 
 
 		 230 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  33.79 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  25.68 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  25.68 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  25.68 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  27.03 
 
 		 278 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  30.67 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  24.67 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  29.8 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  25.33 
 
 		 280 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>