More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0810 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
876 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
876 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
879 aa  738    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
875 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
875 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
876 aa  816    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
879 aa  682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
875 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
880 aa  870    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
880 aa  870    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
876 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 
880 aa  871    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
872 aa  1793    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
892 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
874 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
874 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
880 aa  869    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
880 aa  867    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl613  alanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
892 aa  669    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
880 aa  870    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
865 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
876 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
877 aa  669    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  49.94 
 
 
876 aa  853    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
874 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
876 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
875 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 
874 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
875 aa  658    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
905 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
880 aa  867    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
874 aa  648    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
882 aa  653    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
860 aa  657    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
880 aa  650    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
876 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
880 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
864 aa  656    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
880 aa  869    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
863 aa  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
880 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
880 aa  856    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0159  alanyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
896 aa  671    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
879 aa  687    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
881 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
875 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
878 aa  666    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
878 aa  858    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
883 aa  662    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
876 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
892 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
876 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
860 aa  652    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
875 aa  650    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
876 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
875 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
874 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
874 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
875 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
876 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 
884 aa  944    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
876 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
876 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
876 aa  671    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 
874 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
880 aa  870    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
865 aa  662    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
892 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
878 aa  654    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
879 aa  655    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
879 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
874 aa  656    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  43.55 
 
 
876 aa  673    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
874 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
874 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
876 aa  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
874 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
880 aa  683    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
874 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
880 aa  870    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
874 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  72.82 
 
 
872 aa  1326    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
885 aa  926    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
882 aa  941    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 
893 aa  895    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  82.57 
 
 
872 aa  1504    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
874 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
876 aa  698    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
877 aa  866    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
874 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
878 aa  716    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
878 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
874 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  49.94 
 
 
876 aa  853    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
900 aa  658    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
876 aa  674    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
876 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
876 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
876 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
899 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>