More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0764 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  100 
 
 
401 aa  828    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1818  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  64.04 
 
 
403 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  59.66 
 
 
425 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.81 
 
 
380 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113377  normal  0.236681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2379  putative dimethyl sulfoniopropionate demethylase  38.42 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.649879  normal  0.648384 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1444  putative dimethyl sulfoniopropionate demethylase  37.2 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8924  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2320  putative dimethyl sulfoniopropionate demethylase  35.75 
 
 
368 aa  225  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.59 
 
 
761 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.45 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.99 
 
 
366 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  31.14 
 
 
370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.13 
 
 
789 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.74 
 
 
772 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  31.14 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.65 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.67 
 
 
789 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.65 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.65 
 
 
366 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.86 
 
 
368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.65 
 
 
366 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.38 
 
 
366 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.38 
 
 
366 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.38 
 
 
366 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.38 
 
 
366 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  29.89 
 
 
371 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.65 
 
 
364 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.16 
 
 
752 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.33 
 
 
789 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.65 
 
 
366 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.95 
 
 
400 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.56 
 
 
364 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.65 
 
 
360 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  30.43 
 
 
757 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 
364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  31.95 
 
 
369 aa  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  30.46 
 
 
361 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.83 
 
 
790 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.55 
 
 
365 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  29.07 
 
 
371 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.93 
 
 
781 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.61 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.8 
 
 
360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.11 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.18 
 
 
360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.35 
 
 
360 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.61 
 
 
360 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.21 
 
 
375 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  30.09 
 
 
363 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28 
 
 
364 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.53 
 
 
441 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  28 
 
 
365 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  30.27 
 
 
357 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  30.95 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  29.51 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  29.49 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.23 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  30 
 
 
364 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  28.9 
 
 
389 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  28.1 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.42 
 
 
362 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5961  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.22 
 
 
370 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0205836 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.09 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.87 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0439  aminomethyltransferase  32.23 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.525568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3605  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.41 
 
 
378 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.16 
 
 
365 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  29.23 
 
 
375 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.82 
 
 
380 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.65 
 
 
359 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.59 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.35 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.12 
 
 
379 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.51 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.51 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.19 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  32.88 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  27.62 
 
 
381 aa  129  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.01 
 
 
372 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  26 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  29.83 
 
 
977 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  26.36 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.09 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  31.09 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  29.02 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.62 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  28.97 
 
 
379 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.13 
 
 
376 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  28.28 
 
 
366 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  28.27 
 
 
366 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.61 
 
 
372 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.51 
 
 
372 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.38 
 
 
363 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.38 
 
 
963 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  26.88 
 
 
440 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  26.88 
 
 
442 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  28.53 
 
 
968 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  27.14 
 
 
367 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 
370 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  29.14 
 
 
363 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>