More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0515 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 290 aa  569  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  37.65 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  35.4 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2616  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 		 280 aa  96.3  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  32.69 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  35.68 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.73 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  27.99 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4995  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  34.98 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  41.53 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.87 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  33.9 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  27.87 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  27.46 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  40.17 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.04 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  32.2 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  32.2 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  32.2 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  32.2 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.16 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  44.14 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  31.22 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.75 
 
 		 370 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  33.05 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  30.8 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  30.07 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  44.14 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  37.8 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.79 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1389  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  33.99 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  33.99 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  37.31 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  38.73 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  33.07 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  32.5 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  32.5 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  32.5 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  34.91 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  33.33 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.1 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  39.42 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  31.87 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  31.18 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  39.42 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>