129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0352 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  100 
 
 		 270 aa  537  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  46.07 
 
 		 280 aa  205  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  47.06 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  47.17 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  42.08 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  36.33 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  40.85 
 
 		 342 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  33.68 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  33.68 
 
 		 308 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  36 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  39.46 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  36.36 
 
 		 315 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  35.98 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  35.17 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  33.59 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  30.57 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  30.15 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  30.86 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  30.97 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  29.78 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  36.63 
 
 		 321 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  32.12 
 
 		 318 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  30.4 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  30.4 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  31.36 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  34.53 
 
 		 329 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  34.53 
 
 		 329 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  34.53 
 
 		 329 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  32.21 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  29.1 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  31.8 
 
 		 351 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  31.8 
 
 		 351 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  32.44 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  32.16 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  32.86 
 
 		 317 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  29.6 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  33.8 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  29.9 
 
 		 398 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  29.07 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  33.62 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  31.3 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  28.45 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  29.2 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  33.02 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  33.07 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  27.18 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  29.26 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  25.9 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  27.57 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  30.86 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.48 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  29.18 
 
 		 336 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  29.89 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  28.85 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  26.62 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  24.6 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25.79 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  27.51 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  28.71 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  28.71 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  28.71 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  29 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  28.38 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  30.23 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  30.23 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  27.45 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  26.1 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  28.32 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  29.32 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  30.29 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  28.95 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  23.29 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  25.36 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  28.57 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  29.07 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  24.58 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  27.75 
 
 		 323 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.57 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  29.57 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  27.87 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 326 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  28 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  26.38 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  27.36 
 
 		 340 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  28.46 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  26.76 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  23.95 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  26.17 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  29.19 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  26.03 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  28.57 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  24.3 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  30.77 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  35.92 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  24.91 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>