More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1861 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1861  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  229  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  81.82 
 
 		 286 aa  157  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  80.68 
 
 		 286 aa  150  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  80.49 
 
 		 280 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  80.49 
 
 		 280 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  60.71 
 
 		 259 aa  110  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  58.33 
 
 		 278 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  58.43 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  57.47 
 
 		 272 aa  104  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  58.43 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  58.43 
 
 		 277 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  58.43 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  56.98 
 
 		 286 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  57.65 
 
 		 270 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  57.65 
 
 		 270 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  58.54 
 
 		 296 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  58.54 
 
 		 296 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  58.54 
 
 		 296 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  58.54 
 
 		 296 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  57.65 
 
 		 270 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  57.65 
 
 		 270 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  57.65 
 
 		 270 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  57.65 
 
 		 270 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  57.65 
 
 		 270 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  59.04 
 
 		 267 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  59.04 
 
 		 269 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  59.04 
 
 		 267 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  56.47 
 
 		 291 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  56.47 
 
 		 291 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  56.47 
 
 		 291 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  58.54 
 
 		 296 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  58.54 
 
 		 296 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00504  ISxac3 transposase  57.14 
 
 		 272 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  56.63 
 
 		 290 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  59.76 
 
 		 291 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  59.76 
 
 		 291 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  59.76 
 
 		 291 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2722  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  49.5 
 
 		 272 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3747  ISRSO8-transposase orfB protein  49.5 
 
 		 119 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.916581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3750  putative transposase B  54.65 
 
 		 198 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4612  transposase  59.04 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  0.0596523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  53.93 
 
 		 231 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 		 274 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  52.81 
 
 		 281 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  61.73 
 
 		 288 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1233  putative transposase B  48.51 
 
 		 272 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1298  putative transposase B  48.51 
 
 		 272 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  40.87 
 
 		 289 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  41.44 
 
 		 289 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  41.44 
 
 		 289 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  54.22 
 
 		 279 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0644  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  54.32 
 
 		 255 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2460  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  54.32 
 
 		 255 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.593171  normal  0.440757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  45.92 
 
 		 239 aa  93.6  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  52.33 
 
 		 293 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  52.33 
 
 		 293 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  50.59 
 
 		 294 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  52.33 
 
 		 293 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  54.02 
 
 		 283 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  54.02 
 
 		 283 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  50.59 
 
 		 294 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  50.59 
 
 		 294 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  50.59 
 
 		 294 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  50.59 
 
 		 294 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  52.87 
 
 		 283 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 383 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  48.35 
 
 		 269 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2230  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 198 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.226944  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  54.22 
 
 		 279 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  51.81 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  53.41 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  51.81 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  52.33 
 
 		 298 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  52.33 
 
 		 298 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  52.33 
 
 		 298 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>