More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3747 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  99.16 
 
 
272 aa  250  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3747  ISRSO8-transposase orfB protein  100 
 
 
119 aa  249  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.916581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1233  putative transposase B  98.32 
 
 
272 aa  248  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1298  putative transposase B  98.32 
 
 
272 aa  248  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3750  putative transposase B  98.32 
 
 
198 aa  247  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  57.55 
 
 
281 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  56.36 
 
 
296 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  56.36 
 
 
296 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  56.48 
 
 
296 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  56.48 
 
 
296 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  56.48 
 
 
296 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  56.48 
 
 
296 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  62.11 
 
 
286 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  52.88 
 
 
272 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  51.85 
 
 
277 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  51.85 
 
 
291 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  61.46 
 
 
286 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  47.46 
 
 
294 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  47.46 
 
 
294 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  47.46 
 
 
294 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  47.46 
 
 
294 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  47.46 
 
 
294 aa  120  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  56.25 
 
 
290 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  58.51 
 
 
280 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  58.51 
 
 
280 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  49.53 
 
 
275 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  49.53 
 
 
275 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  49.53 
 
 
275 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  57 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  54.63 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  54.63 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  54.63 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  56.19 
 
 
269 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  54.63 
 
 
267 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  54.63 
 
 
267 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1393  Integrase catalytic region  50.93 
 
 
271 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2887  Integrase catalytic region  50.93 
 
 
271 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  54.63 
 
 
293 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  50.93 
 
 
270 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  54.63 
 
 
293 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  50.93 
 
 
270 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  51.89 
 
 
289 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  51.89 
 
 
289 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  50 
 
 
286 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  50 
 
 
286 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  51.79 
 
 
291 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  51.79 
 
 
291 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  50.91 
 
 
259 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  48.21 
 
 
274 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  48.21 
 
 
286 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  50 
 
 
289 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  50 
 
 
289 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  50 
 
 
289 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  52.68 
 
 
180 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  50 
 
 
275 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  50 
 
 
270 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  50 
 
 
270 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  49.57 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  49.57 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  50 
 
 
270 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  50 
 
 
270 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 
274 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  49.07 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  50 
 
 
270 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  46.43 
 
 
278 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  50 
 
 
279 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  53.77 
 
 
291 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  53.77 
 
 
291 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  53.77 
 
 
291 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  53.21 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  53.33 
 
 
291 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  53.33 
 
 
291 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  53.33 
 
 
291 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  50.44 
 
 
270 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  48.15 
 
 
286 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1358  integrase catalytic subunit  46.85 
 
 
208 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  46.85 
 
 
284 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  46.85 
 
 
284 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  46.85 
 
 
284 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>