More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3550 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 375 aa  747    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.89 
 
 		 391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0177  ABC transporter related  53.66 
 
 		 385 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0132  ABC transporter related  54.99 
 
 		 384 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3148  ABC transporter related  52.16 
 
 		 384 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  50.79 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1770  ABC transporter related  49.34 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636101  decreased coverage  0.00357448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  48.66 
 
 		 361 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  48.66 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1183  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.06 
 
 		 392 aa  312  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0969985  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1086  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.06 
 
 		 392 aa  311  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1669  ABC transporter related  48.56 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  47.85 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7593  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.74 
 
 		 397 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  47.7 
 
 		 353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  45.43 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  47.21 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  47.85 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.45 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  45.05 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.43 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  46.4 
 
 		 359 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  48.61 
 
 		 332 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  45.99 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  47.2 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  44.06 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  45.92 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  44.79 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  45.38 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  46.69 
 
 		 332 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  47.92 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.51 
 
 		 351 aa  292  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  48.75 
 
 		 332 aa  291  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  46.97 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03901  ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 415 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.51 
 
 		 351 aa  291  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  46.7 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.74 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5670  ABC transporter related  55.97 
 
 		 395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  46.81 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  46.58 
 
 		 351 aa  289  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  44.3 
 
 		 369 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.94 
 
 		 351 aa  289  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  46.15 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  49.38 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  47.38 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 		 352 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  45.48 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  45.04 
 
 		 354 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  45.38 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  47.01 
 
 		 372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  47.38 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.15 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  44.32 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  46.34 
 
 		 368 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  44.54 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.85 
 
 		 386 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  44.5 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  46.7 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  44.5 
 
 		 381 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  43.62 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  46.81 
 
 		 332 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 335 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 379 aa  285  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  42.62 
 
 		 349 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  48.14 
 
 		 356 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  46.88 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  44.96 
 
 		 357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  46.15 
 
 		 334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  44.95 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0510  ATPase  44.88 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136787  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  44.69 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  46.58 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  46.47 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  48.6 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  46.77 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0844  ABC transporter related protein  44.15 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.46 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3448  ABC transporter related  50 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  43.38 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  45.74 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  43.7 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  43.81 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  44.44 
 
 		 366 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2551  ABC transporter related  47.51 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  42.74 
 
 		 385 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  46.24 
 
 		 354 aa  282  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.97 
 
 		 369 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  43.48 
 
 		 352 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  50.3 
 
 		 325 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  46.72 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  46.7 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  44.48 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  43.42 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>