More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5670 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5670  ABC transporter related  100 
 
 		 395 aa  793    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3448  ABC transporter related  68.93 
 
 		 393 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  42.71 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  46.94 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  45.74 
 
 		 351 aa  329  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 369 aa  328  9e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  43.86 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  43.07 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 398 aa  326  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  52.03 
 
 		 416 aa  325  8.000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  48.47 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  47.16 
 
 		 353 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  43.11 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  48.72 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 364 aa  323  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  45.8 
 
 		 360 aa  323  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  47.34 
 
 		 355 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  45.24 
 
 		 366 aa  322  6e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.69 
 
 		 367 aa  322  8e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.69 
 
 		 367 aa  322  8e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  45.18 
 
 		 370 aa  322  8e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  46.84 
 
 		 354 aa  322  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  43.83 
 
 		 369 aa  322  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  45.32 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  46.72 
 
 		 357 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.32 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.35 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  53.47 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  44.78 
 
 		 405 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  44.78 
 
 		 405 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  44.78 
 
 		 405 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 399 aa  318  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  47.04 
 
 		 371 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  43.29 
 
 		 370 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  46.29 
 
 		 375 aa  318  9e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  44.9 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.7 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  46.67 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  43.58 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  43.85 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  45.38 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  44.25 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  45.04 
 
 		 356 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  44.67 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  45.69 
 
 		 353 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  44.36 
 
 		 352 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  45.92 
 
 		 380 aa  316  5e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50.74 
 
 		 353 aa  316  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  46.67 
 
 		 371 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  45.43 
 
 		 353 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  49.11 
 
 		 352 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  46.04 
 
 		 365 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  43.8 
 
 		 367 aa  315  8e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.38 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  44.53 
 
 		 398 aa  314  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.23 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  45.36 
 
 		 380 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  45.84 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  46.67 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  46.26 
 
 		 372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  43.04 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  46.04 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  45.74 
 
 		 370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  45.2 
 
 		 372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 		 371 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  46.37 
 
 		 372 aa  312  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  46.42 
 
 		 371 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  43.61 
 
 		 371 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  44.5 
 
 		 355 aa  311  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  46.29 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  47.72 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 371 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  49.55 
 
 		 361 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  50.45 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  43.97 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  46.27 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  44.07 
 
 		 349 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  47.45 
 
 		 365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.96 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  43.7 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  44.64 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  41.16 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  51.8 
 
 		 359 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  42.61 
 
 		 393 aa  309  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  45.41 
 
 		 367 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  43.62 
 
 		 364 aa  309  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  44.5 
 
 		 366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  44.13 
 
 		 355 aa  309  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  52.04 
 
 		 370 aa  309  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  45.13 
 
 		 364 aa  308  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  45.15 
 
 		 355 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 368 aa  308  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  43.29 
 
 		 384 aa  308  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  45.97 
 
 		 364 aa  308  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  44.95 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>