More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3166 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  80.26 
 
 		 457 aa  788    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  936    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  77.85 
 
 		 458 aa  762    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  67.68 
 
 		 460 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  79.39 
 
 		 459 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  68.21 
 
 		 456 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  74.29 
 
 		 457 aa  719    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  79.87 
 
 		 457 aa  782    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  79.17 
 
 		 459 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  61.18 
 
 		 468 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  60 
 
 		 465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  59.11 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  60.81 
 
 		 464 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  59.43 
 
 		 468 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  60.81 
 
 		 464 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  59.46 
 
 		 465 aa  567  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  60.59 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  60.59 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  60.81 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  60.81 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  60.92 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  54.19 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  54.99 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  54.61 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  53.54 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  44.64 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  45.33 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  44.62 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  44.02 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  43.3 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  44.32 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  44.62 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  44.62 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  43.98 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  44.4 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  43.27 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  42.15 
 
 		 456 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  42.89 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  42.41 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  42.44 
 
 		 485 aa  362  8e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  41.89 
 
 		 461 aa  360  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  41.69 
 
 		 458 aa  352  7e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  41.08 
 
 		 456 aa  349  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  41.42 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  41.23 
 
 		 460 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  39.87 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.69 
 
 		 466 aa  340  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  41.78 
 
 		 463 aa  339  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  42.44 
 
 		 449 aa  339  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  43.18 
 
 		 451 aa  339  8e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  41.65 
 
 		 462 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  40.77 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  41.1 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  39.24 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.6 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  40.44 
 
 		 454 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  40.92 
 
 		 467 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  40.92 
 
 		 458 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  42.16 
 
 		 466 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  43.16 
 
 		 457 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  40.62 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  40.18 
 
 		 471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  39.5 
 
 		 450 aa  326  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  42 
 
 		 457 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  42.38 
 
 		 466 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  41.98 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  40.09 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  41.61 
 
 		 453 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  41.61 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40.04 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  38.89 
 
 		 456 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  38.89 
 
 		 456 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  41.93 
 
 		 466 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  40.31 
 
 		 452 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  39.31 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  40.81 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  41.13 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  40.53 
 
 		 457 aa  319  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  37.36 
 
 		 451 aa  318  9e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  41.52 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  40.59 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  41.52 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  42.95 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.11 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  41.04 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  38.77 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  41.04 
 
 		 454 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  41.7 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  41.7 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  39.87 
 
 		 452 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  40.18 
 
 		 452 aa  315  7e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  41.7 
 
 		 466 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  39.17 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  40.6 
 
 		 465 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  39.46 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  38.93 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  38.72 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  39.42 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  38.93 
 
 		 480 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>