More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3413 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3413  ABC transporter component  100 
 
 		 233 aa  453  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3843  ABC transporter related  57.94 
 
 		 235 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  58.37 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1544  ABC transporter related  61.47 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  49.57 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  47.64 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  47.66 
 
 		 243 aa  191  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  48.71 
 
 		 242 aa  190  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  45.73 
 
 		 280 aa  184  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  42.13 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.11 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  46.15 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  42.74 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  45.92 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  42.55 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  42.49 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  43.78 
 
 		 277 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  40.77 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  42.98 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  42.8 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 279 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  45.96 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.38 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  45.73 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  40.68 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  41.81 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  42.49 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  40.95 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  40.95 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  40.95 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  36.13 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  41.95 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  40.95 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  40.95 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  45.11 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  44.21 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  44.21 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  42.22 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  38.2 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  40.52 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  43.53 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  37.77 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  41.6 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.34 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.34 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.34 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  37.55 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.34 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0504  ABC transporter related  44.68 
 
 		 254 aa  169  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.34 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  41.2 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3332  ABC transporter related  39.57 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  37.45 
 
 		 238 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  39.06 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  38.63 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.81 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  41.81 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  40.25 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  37.61 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0288  ABC transporter related  40.25 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  42.55 
 
 		 284 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1826  ABC transporter related  43.53 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  43.16 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  40.85 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  37.02 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  37.02 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  37.45 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  37.02 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  39.06 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  41.38 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  36.17 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  37.45 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  37.45 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  40.6 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  42.31 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.75 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.52 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>