More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2769 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  93.2 
 
 		 294 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  53.47 
 
 		 294 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  47.4 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  45.3 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  46.4 
 
 		 287 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  42.31 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  44.41 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  44.91 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  44.91 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 		 299 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  41.73 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  41.99 
 
 		 302 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  44.77 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  38.87 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  38.25 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  36.9 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 288 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  40.14 
 
 		 304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  35.79 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  36.14 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  36.01 
 
 		 290 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  37.89 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  36.26 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  37.18 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  36.27 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 289 aa  169  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  36.71 
 
 		 292 aa  168  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  37.15 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  35.35 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  36.24 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  37.05 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1243  dihydrodipicolinate synthase  40.7 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323675  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  36.27 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  36.82 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  36.33 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  37.18 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  34.86 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  42.5 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  34.64 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  36.75 
 
 		 292 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  35.42 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  38.13 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  36.96 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  36.14 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  35.47 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  35.87 
 
 		 292 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  35.87 
 
 		 292 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  35.87 
 
 		 292 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  35.87 
 
 		 292 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  35.87 
 
 		 292 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2135  dihydrodipicolinate synthase  39.78 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483756  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  35.56 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  36.5 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  35.49 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>