More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4108 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  78.42 
 
 		 432 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  88.97 
 
 		 430 aa  765    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  868    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  69.34 
 
 		 430 aa  585  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  66.9 
 
 		 441 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  68.04 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  48.4 
 
 		 417 aa  358  9e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  44.12 
 
 		 420 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  45.62 
 
 		 417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  40.53 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  39.9 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  40 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  40.39 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  40.15 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  39.15 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  39.29 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  42.29 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  42.82 
 
 		 413 aa  262  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  37.68 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  35.24 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  39.04 
 
 		 414 aa  249  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  38.73 
 
 		 440 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  38.73 
 
 		 440 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  39.09 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  38.73 
 
 		 440 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  38.73 
 
 		 440 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  38.83 
 
 		 414 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  38.89 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  39.34 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  38.8 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  37.78 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  37.5 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  37.28 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  36.86 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  30.77 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.72 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  32.57 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  30.35 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  28.99 
 
 		 391 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.56 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  30.27 
 
 		 395 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.68 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.38 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.1 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  28.33 
 
 		 377 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  31.46 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.46 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  32.18 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  29.51 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29.02 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.59 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  27.98 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  29.35 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  30.49 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  29.19 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.19 
 
 		 360 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  29.19 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  32.2 
 
 		 412 aa  99.8  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.94 
 
 		 402 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  27.91 
 
 		 377 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.56 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  30.51 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  28.74 
 
 		 388 aa  97.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  28.83 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  29.18 
 
 		 384 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  27.43 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  27.96 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.65 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.72 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  27.3 
 
 		 401 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  27.52 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.84 
 
 		 377 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.15 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  27.47 
 
 		 378 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  27.64 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.66 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  30.7 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28.31 
 
 		 392 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  30.59 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.87 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  30.41 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  27.73 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  28.57 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  26.72 
 
 		 697 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  30.27 
 
 		 374 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  27.54 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  28.98 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.06 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  23.67 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.47 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  26.14 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  30.38 
 
 		 384 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  29.49 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  28.45 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  29.21 
 
 		 391 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  29.21 
 
 		 391 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>