More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2399 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  259  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  75.61 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2406  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  45 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2885  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2318  response regulator receiver protein  53.1 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6494  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5741  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621186  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  44.26 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 256 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6166  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 132 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 209 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 210 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 210 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 210 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 210 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6901  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279255  normal  0.546779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 206 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 208 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 241 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 228 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 210 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 250 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2455  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  39.02 
 
 		 204 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1546  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.028816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 213 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.8 
 
 		 212 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 212 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  40.16 
 
 		 212 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 212 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 212 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 226 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 220 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 212 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 212 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 212 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 212 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  39.34 
 
 		 209 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 210 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  41.38 
 
 		 202 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  37.4 
 
 		 212 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 208 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 224 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.75 
 
 		 209 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 214 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 210 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 214 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 214 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 214 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5182  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0583  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.52 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  35.9 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  38.39 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0844  response regulator receiver protein  40 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.26 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  34.17 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  36.75 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  39.13 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 208 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 215 aa  80.1  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 213 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 204 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.68 
 
 		 214 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  36.75 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.52 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>