64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2366 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  320  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  92.45 
 
 		 159 aa  278  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  52.07 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  33.88 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  35.71 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  42.62 
 
 		 241 aa  84  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  41.32 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  45.38 
 
 		 287 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  41.35 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  51.58 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.35 
 
 		 1180 aa  73.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  34.38 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.48 
 
 		 1265 aa  71.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.62 
 
 		 1171 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.32 
 
 		 1306 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.6 
 
 		 1390 aa  67.4  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  37.39 
 
 		 673 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  33.91 
 
 		 669 aa  58.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.71 
 
 		 1274 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  30.32 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  34.23 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  34.23 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  34.23 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  34.23 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  29.63 
 
 		 373 aa  53.9  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  31.58 
 
 		 722 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  30.83 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  36.59 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  36.59 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  28.46 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  30.97 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  25.76 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  28.19 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  28.15 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  31.5 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  25.76 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  31.55 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  30.7 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  29.82 
 
 		 358 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  29.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  29.75 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  26.05 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  35.71 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  34.48 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  31.13 
 
 		 875 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  30.56 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  37.93 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  29.91 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  33.82 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  26 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  27.81 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  28.1 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  26.67 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  27.59 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  26.52 
 
 		 159 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  27.35 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  27.35 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1935  hypothetical protein  32.38 
 
 		 258 aa  41.2  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.187916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  23.12 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  33.33 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3376  blue (type 1) copper domain protein  28.93 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176163  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4335  hypothetical protein  26.8 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.0167527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  40.82 
 
 		 362 aa  40.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>