More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0226 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 271 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  85.19 
 
 		 271 aa  471  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  60.47 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  30.64 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.22 
 
 		 262 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.02 
 
 		 374 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.9 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  30.42 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.07 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  28.69 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.87 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.29 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  28.93 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.88 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  25.88 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.14 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.35 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  29.78 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 		 386 aa  78.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.6 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.51 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.51 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.51 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.54 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.34 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  27.69 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.05 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.51 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.28 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 431 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  29.67 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  27.6 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.53 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.34 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.75 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  25.74 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  27.89 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  29.18 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>