More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0205 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0205  response regulator receiver protein  100 
 
 
136 aa  273  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.879703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2144  response regulator receiver protein  52.24 
 
 
148 aa  140  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2148  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
141 aa  130  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1271  response regulator receiver protein  43.61 
 
 
138 aa  123  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4403  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1609  response regulator receiver protein  42.22 
 
 
155 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1710  response regulator receiver protein  36.88 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198048  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  40 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
128 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 
1284 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  38.6 
 
 
1287 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
1177 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1833  response regulator receiver protein  38.89 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
1163 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  38.26 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  38.66 
 
 
1028 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  38.26 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.99 
 
 
395 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3343  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
800 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.339102  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.37 
 
 
944 aa  77.4  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1155 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1155 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1155 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1149 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1168 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  34.65 
 
 
1170 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  38.05 
 
 
779 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1374 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  38.05 
 
 
786 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  43.22 
 
 
2109 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
1159 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  34.65 
 
 
1172 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
865 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
1333 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1356 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
782 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
702 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1611 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
913 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
1303 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
920 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1839 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
1161 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
764 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
1166 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.68 
 
 
655 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
1245 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
1141 aa  73.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1857 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1160 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.5 
 
 
858 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
1199 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  35.65 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  33.06 
 
 
802 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  31.15 
 
 
1161 aa  73.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  35.61 
 
 
795 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
802 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 
981 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
876 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
554 aa  73.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1189 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  33.82 
 
 
1137 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
1310 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
1137 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  40 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1896 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
1352 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  38.02 
 
 
702 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  37.19 
 
 
762 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.29 
 
 
1331 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1287 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
657 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.73 
 
 
1266 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
702 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1588 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1159 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1575  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
577 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.420465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
787 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  32.73 
 
 
891 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  38.71 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  34.75 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  36.36 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
757 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  33.33 
 
 
772 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>