240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5523 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 354 aa  730    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  54.6 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  54.3 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  55.15 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  53.71 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  54.35 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  54.05 
 
 		 368 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  56.27 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  56.27 
 
 		 361 aa  359  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  53.35 
 
 		 358 aa  358  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  51.76 
 
 		 363 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  53.94 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  54.4 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  53.63 
 
 		 361 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  53.54 
 
 		 368 aa  355  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  52.98 
 
 		 368 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  52.08 
 
 		 363 aa  352  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  52.24 
 
 		 368 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  54.18 
 
 		 368 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  54.18 
 
 		 368 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  54.18 
 
 		 368 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  54.18 
 
 		 368 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  54.18 
 
 		 368 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  54.18 
 
 		 368 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  54.18 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  51.69 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  52.55 
 
 		 362 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  47.13 
 
 		 337 aa  345  6e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  52.01 
 
 		 354 aa  345  7e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  52.73 
 
 		 363 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  50.3 
 
 		 346 aa  344  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  51.42 
 
 		 356 aa  342  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  50.31 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  50.78 
 
 		 359 aa  332  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  47.94 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  49.39 
 
 		 353 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  49.1 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  51.69 
 
 		 342 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  47.93 
 
 		 352 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  48.9 
 
 		 358 aa  317  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  51.68 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  47.68 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  51.68 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  50.76 
 
 		 343 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  50.46 
 
 		 343 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  47.31 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  50.9 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  50.75 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  51.38 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  50.82 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  50.16 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  49.06 
 
 		 352 aa  309  5.9999999999999995e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  48.32 
 
 		 343 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  45.07 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  47.01 
 
 		 353 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  48.21 
 
 		 358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  46.97 
 
 		 353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  47.59 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  46.67 
 
 		 353 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  44.58 
 
 		 388 aa  299  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  47.49 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  47.97 
 
 		 344 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  46.62 
 
 		 344 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  46.97 
 
 		 352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  47.3 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  42.72 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  42.4 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  38.58 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  37.31 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  41.4 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  44.44 
 
 		 264 aa  203  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.47 
 
 		 349 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  36.89 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.13 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  38.12 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  39.31 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.38 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  34.53 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.91 
 
 		 359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  37.62 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  36.2 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  34.03 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  39.24 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  36.76 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  35.47 
 
 		 357 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  33.96 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  35.49 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  35.49 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  35.49 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>