209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5120 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0020  hypothetical protein  94.33 
 
 		 354 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5120  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  736    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2007  hypothetical protein  70.37 
 
 		 352 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5079  hypothetical protein  68.09 
 
 		 352 aa  527  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3902  hypothetical protein  69.16 
 
 		 352 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2011  hypothetical protein  70.03 
 
 		 352 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5051  hypothetical protein  67.61 
 
 		 352 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4631  hypothetical protein  66.57 
 
 		 352 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00375175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2143  hypothetical protein  68.02 
 
 		 352 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3842  hypothetical protein  67.93 
 
 		 351 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7177  hypothetical protein  67.73 
 
 		 350 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1731  hypothetical protein  67.15 
 
 		 352 aa  494  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5286  hypothetical protein  65.42 
 
 		 355 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1587  hypothetical protein  67.44 
 
 		 351 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1606  hypothetical protein  67.44 
 
 		 351 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522694  normal  0.309997 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6358  hypothetical protein  67.35 
 
 		 351 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2044  hypothetical protein  65.89 
 
 		 351 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4842  hypothetical protein  66.86 
 
 		 351 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174073  normal  0.0113418 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2334  hypothetical protein  65.89 
 
 		 351 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3101  hypothetical protein  65.89 
 
 		 351 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1067  hypothetical protein  65.89 
 
 		 351 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1352  hypothetical protein  65.89 
 
 		 351 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1441  hypothetical protein  65.89 
 
 		 351 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3954  protein of unknown function DUF849  65.99 
 
 		 349 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1597  hypothetical protein  64.18 
 
 		 356 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3841  protein of unknown function DUF849  65.99 
 
 		 349 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.839397  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2174  hypothetical protein  64.39 
 
 		 352 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2818  hypothetical protein  62.46 
 
 		 350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2675  hypothetical protein  62.46 
 
 		 350 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  61.38 
 
 		 351 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  26.62 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  25.57 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  27.18 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  24.59 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.25 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  26.71 
 
 		 293 aa  94  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  25.32 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  25.08 
 
 		 272 aa  90.9  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  27.55 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  24.91 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  26.27 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  25.47 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  25.16 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  26.32 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  24.66 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  26.71 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.6 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  24.68 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  24.84 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.12 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.92 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  19.74 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  25.24 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  22.02 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  23.47 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  25.16 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  24.13 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  26.6 
 
 		 272 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  21.54 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  25.81 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  25.39 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  24.61 
 
 		 310 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  24.09 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  25.48 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  24.57 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  26.79 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  23.15 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  22.15 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  24.37 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  25.24 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  22.48 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  20.38 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  23.71 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  23.05 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  25.79 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  23.02 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  21.34 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  24.39 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  22.19 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  25.94 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  23.03 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  22.04 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  25.32 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  25.32 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  22.98 
 
 		 288 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  22.4 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  24.68 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  24.91 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  25.32 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  25.32 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  24.62 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  22.6 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  22.71 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  24.44 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  23.91 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  24.13 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  21.38 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.95 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  21.72 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>