201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4793 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  100 
 
 		 659 aa  1320    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  48.67 
 
 		 682 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  47.28 
 
 		 625 aa  535  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  45.06 
 
 		 700 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  46.31 
 
 		 718 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  46.42 
 
 		 719 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  44.08 
 
 		 700 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  46.58 
 
 		 713 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  46.42 
 
 		 710 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  45.35 
 
 		 710 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  46.42 
 
 		 707 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  46.42 
 
 		 707 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  46.12 
 
 		 707 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  43.01 
 
 		 691 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  45.51 
 
 		 687 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  39.41 
 
 		 695 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  39.11 
 
 		 695 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  39.26 
 
 		 695 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  39.7 
 
 		 695 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  39.49 
 
 		 687 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  41.87 
 
 		 693 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  38.95 
 
 		 688 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  38.51 
 
 		 695 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.2 
 
 		 680 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.57 
 
 		 679 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.58 
 
 		 670 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  40.86 
 
 		 679 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.97 
 
 		 680 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  35.5 
 
 		 698 aa  349  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  38.02 
 
 		 690 aa  345  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.19 
 
 		 672 aa  340  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  34.34 
 
 		 681 aa  334  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  34.84 
 
 		 697 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.07 
 
 		 692 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.88 
 
 		 688 aa  319  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  30.85 
 
 		 716 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  29.84 
 
 		 749 aa  272  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  31.15 
 
 		 704 aa  265  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  31.14 
 
 		 702 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.47 
 
 		 697 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  34.31 
 
 		 639 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  30.5 
 
 		 713 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.09 
 
 		 653 aa  234  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  28.36 
 
 		 676 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.5 
 
 		 676 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.56 
 
 		 673 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.95 
 
 		 691 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.56 
 
 		 673 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.56 
 
 		 673 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  29.19 
 
 		 662 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  28.98 
 
 		 662 aa  147  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  25.04 
 
 		 670 aa  145  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.36 
 
 		 676 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.52 
 
 		 662 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.56 
 
 		 679 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  28.36 
 
 		 676 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  26.65 
 
 		 664 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  28.24 
 
 		 662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  26.71 
 
 		 730 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  25.88 
 
 		 734 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  26.19 
 
 		 726 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  25.72 
 
 		 734 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  25.72 
 
 		 734 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.05 
 
 		 724 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  25.96 
 
 		 724 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.04 
 
 		 699 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  26.18 
 
 		 734 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  25.88 
 
 		 733 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  25.44 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  25.75 
 
 		 727 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  27.55 
 
 		 733 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.52 
 
 		 739 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.56 
 
 		 653 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  25.68 
 
 		 679 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.68 
 
 		 679 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  25.86 
 
 		 679 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  25.32 
 
 		 679 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.68 
 
 		 679 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  25.96 
 
 		 663 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  25.78 
 
 		 670 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.96 
 
 		 670 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  32.02 
 
 		 744 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01615  conserved inner membrane protein  25.78 
 
 		 670 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174689  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.78 
 
 		 670 aa  122  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1856  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.78 
 
 		 670 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0794628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.78 
 
 		 670 aa  122  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  26 
 
 		 690 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  25.45 
 
 		 670 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  39.62 
 
 		 728 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  26 
 
 		 690 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  39.62 
 
 		 729 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  24.26 
 
 		 733 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  26 
 
 		 690 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.73 
 
 		 733 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.53 
 
 		 733 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  24.26 
 
 		 733 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  24.26 
 
 		 733 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  24.26 
 
 		 733 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  24.26 
 
 		 733 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  26 
 
 		 711 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>