More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4195 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4195  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
515 aa  1013    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.13 
 
 
601 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947036  normal  0.198959 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.46 
 
 
519 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1092  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.74 
 
 
605 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1156  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  58.06 
 
 
600 aa  458  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 
519 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330697  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 
519 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0128017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.26 
 
 
555 aa  356  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.17 
 
 
572 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 
618 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 
617 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.13 
 
 
567 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.23 
 
 
597 aa  347  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51670  methyl accepting chemotaxis sensory transducer  45.06 
 
 
566 aa  343  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.11 
 
 
513 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.26 
 
 
673 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.26 
 
 
673 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.26 
 
 
673 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.26 
 
 
673 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  41.29 
 
 
547 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.26 
 
 
673 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  41.29 
 
 
547 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  46.26 
 
 
673 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.26 
 
 
671 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  41.29 
 
 
547 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  40.73 
 
 
547 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.38 
 
 
552 aa  339  9e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.14 
 
 
542 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  43.82 
 
 
553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.19 
 
 
566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.91 
 
 
648 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.15 
 
 
583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.49 
 
 
648 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  41.1 
 
 
547 aa  336  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.65 
 
 
655 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.16 
 
 
562 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.67 
 
 
557 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  59.67 
 
 
557 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
659 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  59.34 
 
 
557 aa  332  9e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.37 
 
 
546 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.47 
 
 
653 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 
525 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.47 
 
 
653 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 
541 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.36 
 
 
537 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27970  chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 
575 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0997024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
579 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  56.36 
 
 
585 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  41.95 
 
 
579 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  62.09 
 
 
553 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.69 
 
 
562 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  55.52 
 
 
543 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.21 
 
 
666 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  61.76 
 
 
553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.76 
 
 
553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  61.76 
 
 
553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  61.76 
 
 
553 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  61.76 
 
 
553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.76 
 
 
553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43 
 
 
576 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.92 
 
 
561 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.52 
 
 
536 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000611014  hitchhiker  0.00000521325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.88 
 
 
573 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.42 
 
 
549 aa  327  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.91 
 
 
572 aa  326  6e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  61.17 
 
 
553 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.4 
 
 
556 aa  325  8.000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  61.17 
 
 
553 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  61.17 
 
 
553 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
659 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
659 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  61.17 
 
 
553 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  54.6 
 
 
470 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.02 
 
 
527 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.02 
 
 
657 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.3 
 
 
548 aa  323  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.84 
 
 
513 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  62.25 
 
 
553 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.3 
 
 
546 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  54.3 
 
 
546 aa  323  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.42 
 
 
553 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.42 
 
 
553 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  54.3 
 
 
546 aa  323  6e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.3 
 
 
546 aa  323  6e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  54.3 
 
 
546 aa  323  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  54.3 
 
 
546 aa  323  6e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.87 
 
 
584 aa  323  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.39 
 
 
661 aa  323  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  54.3 
 
 
546 aa  323  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.42 
 
 
553 aa  323  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 
650 aa  322  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.17 
 
 
559 aa  322  7e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.33 
 
 
567 aa  322  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.31 
 
 
595 aa  322  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  44.27 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.42 
 
 
553 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.22 
 
 
589 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.73 
 
 
589 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.25 
 
 
559 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>