113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1764 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 868 aa  1737    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  34.29 
 
 		 834 aa  439  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6094  Glycogen debranching protein-like protein  21.9 
 
 		 815 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  26.89 
 
 		 733 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.96 
 
 		 734 aa  118  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.42 
 
 		 711 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.84 
 
 		 731 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.57 
 
 		 717 aa  116  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.51 
 
 		 781 aa  115  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.64 
 
 		 716 aa  113  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.23 
 
 		 676 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.51 
 
 		 734 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.43 
 
 		 720 aa  108  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.85 
 
 		 720 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.48 
 
 		 732 aa  108  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.81 
 
 		 757 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  27.56 
 
 		 757 aa  107  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.23 
 
 		 735 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.37 
 
 		 658 aa  107  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.99 
 
 		 735 aa  106  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.84 
 
 		 765 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.55 
 
 		 725 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.4 
 
 		 723 aa  105  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.41 
 
 		 733 aa  105  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.92 
 
 		 708 aa  105  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.26 
 
 		 746 aa  105  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.62 
 
 		 732 aa  104  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  26.56 
 
 		 770 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  25.23 
 
 		 758 aa  103  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.56 
 
 		 776 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.56 
 
 		 797 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.56 
 
 		 776 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  26.56 
 
 		 675 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  23.68 
 
 		 727 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.56 
 
 		 770 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.51 
 
 		 764 aa  103  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.06 
 
 		 778 aa  102  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.15 
 
 		 700 aa  102  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.57 
 
 		 676 aa  101  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.76 
 
 		 759 aa  101  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.26 
 
 		 751 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.21 
 
 		 698 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.54 
 
 		 741 aa  100  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.54 
 
 		 724 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.11 
 
 		 729 aa  100  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.83 
 
 		 778 aa  99  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  27.79 
 
 		 715 aa  98.6  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.83 
 
 		 721 aa  98.2  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.78 
 
 		 778 aa  98.6  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.28 
 
 		 736 aa  97.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.52 
 
 		 719 aa  96.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.28 
 
 		 718 aa  96.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.5 
 
 		 729 aa  95.5  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.12 
 
 		 685 aa  95.1  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.71 
 
 		 733 aa  94.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  27.74 
 
 		 712 aa  94.4  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.96 
 
 		 734 aa  94  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  26.91 
 
 		 723 aa  92.8  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.21 
 
 		 723 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.19 
 
 		 740 aa  92.8  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.99 
 
 		 734 aa  92  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.99 
 
 		 623 aa  92  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.62 
 
 		 685 aa  92.4  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.06 
 
 		 612 aa  91.3  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  25.61 
 
 		 729 aa  90.9  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.58 
 
 		 732 aa  90.5  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  26.21 
 
 		 706 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.38 
 
 		 740 aa  89.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.38 
 
 		 740 aa  89.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.45 
 
 		 722 aa  88.6  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.54 
 
 		 740 aa  88.2  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.17 
 
 		 740 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.87 
 
 		 741 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  25.94 
 
 		 737 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.19 
 
 		 726 aa  85.9  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.36 
 
 		 736 aa  85.9  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.12 
 
 		 691 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.93 
 
 		 733 aa  84.3  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.76 
 
 		 741 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  25.64 
 
 		 758 aa  81.6  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.89 
 
 		 741 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.65 
 
 		 760 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  27.74 
 
 		 751 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.12 
 
 		 740 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.76 
 
 		 691 aa  77.8  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.42 
 
 		 628 aa  76.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.14 
 
 		 751 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.14 
 
 		 751 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.9 
 
 		 776 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.42 
 
 		 708 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  27.94 
 
 		 610 aa  70.1  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.76 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  23.26 
 
 		 810 aa  65.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5513  hypothetical protein  24.83 
 
 		 581 aa  63.9  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  25.08 
 
 		 660 aa  60.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1276  hypothetical protein  25 
 
 		 688 aa  57.4  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  24.35 
 
 		 856 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  23.72 
 
 		 659 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  26.22 
 
 		 672 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  23.08 
 
 		 611 aa  52  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>