More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0843 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0843  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 214 aa  433  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  51.69 
 
 		 209 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1937  50S ribosomal protein L4  47.6 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  53.62 
 
 		 208 aa  204  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  48.76 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  48.79 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  48.31 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  48.79 
 
 		 209 aa  201  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  48.77 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0196  50S ribosomal protein L4  50.48 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.371225 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  48 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  41.46 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  43.33 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  43.43 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  42.51 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  40.3 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  39.81 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  43.07 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  42.03 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  41.06 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  42.08 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  39.57 
 
 		 200 aa  139  4.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  36.41 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  37.86 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  41.15 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  38.19 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  35.35 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 		 206 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  36.59 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  38.83 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  37.19 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  41.08 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  39.51 
 
 		 207 aa  132  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  37.86 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  40.21 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  35.07 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  40.89 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  37.07 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  34.95 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  36.36 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  36.32 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  37.63 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  35.5 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  38.66 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  37.25 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  38.38 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  37.13 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  38.69 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  38.69 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  35.29 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  37.25 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  35.5 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  41.71 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  36.76 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  36.27 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  34.5 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  38.05 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  35.12 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  34.8 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  39.7 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  38.19 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2154  50S ribosomal protein L4P  44.69 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0120405  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  38.19 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  35.03 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  36.27 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  35.96 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  43.56 
 
 		 210 aa  121  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  36.76 
 
 		 206 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  34.8 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  38.12 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>