284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6911 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  100 
 
 
495 aa  969    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  90.08 
 
 
497 aa  878    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  76.32 
 
 
495 aa  731    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  62.35 
 
 
497 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.6 
 
 
497 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  62.69 
 
 
497 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.4 
 
 
497 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.4 
 
 
497 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  59.26 
 
 
549 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  59.26 
 
 
549 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  58.93 
 
 
534 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  57.91 
 
 
504 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  51.96 
 
 
523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  49.79 
 
 
513 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  50.51 
 
 
500 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  49.49 
 
 
507 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  48.65 
 
 
513 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  49.59 
 
 
510 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  49.18 
 
 
510 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  46.75 
 
 
507 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  38.16 
 
 
507 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  36.7 
 
 
516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 
508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  40.25 
 
 
509 aa  306  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  40.95 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  41.21 
 
 
506 aa  297  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  40.73 
 
 
511 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  39.09 
 
 
507 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  42.36 
 
 
499 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
507 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  38.76 
 
 
509 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  40.99 
 
 
506 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  39.3 
 
 
510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  41.6 
 
 
536 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  37.81 
 
 
511 aa  282  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  37.6 
 
 
514 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  37.58 
 
 
519 aa  280  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  38.4 
 
 
511 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
507 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  38.03 
 
 
507 aa  279  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 
506 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
507 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  40.95 
 
 
507 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  38.45 
 
 
510 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
507 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  37.13 
 
 
508 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  41.44 
 
 
514 aa  277  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 
518 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  39.79 
 
 
513 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  38.65 
 
 
510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  41.27 
 
 
508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 
518 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  39.3 
 
 
513 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  38.92 
 
 
513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  41.59 
 
 
518 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  39.01 
 
 
513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  38.92 
 
 
513 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
507 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  39.09 
 
 
513 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  39.09 
 
 
513 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2172  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
507 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  39.09 
 
 
513 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  38.92 
 
 
513 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  38.84 
 
 
512 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  38.72 
 
 
513 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  39.87 
 
 
511 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  42.05 
 
 
515 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  38.51 
 
 
513 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  38.3 
 
 
510 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
507 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  39.51 
 
 
507 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  38.91 
 
 
526 aa  270  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  41.01 
 
 
518 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  38.52 
 
 
510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  39.07 
 
 
510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  41.23 
 
 
517 aa  269  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  40.36 
 
 
507 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
529 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
507 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
529 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  36.76 
 
 
520 aa  268  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  37.15 
 
 
538 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
507 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
507 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
533 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  38.4 
 
 
511 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  37.27 
 
 
511 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  42.11 
 
 
517 aa  266  8.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  39.8 
 
 
514 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  37.44 
 
 
498 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  35.38 
 
 
505 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  34.5 
 
 
523 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  41.47 
 
 
509 aa  262  8.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  37.61 
 
 
506 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  37.26 
 
 
506 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  37.95 
 
 
515 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  37.12 
 
 
524 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  40.84 
 
 
514 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 
510 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>