More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6100 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 336 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  94.05 
 
 		 336 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  58.26 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  52.25 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  52.12 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  51.52 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  50.15 
 
 		 342 aa  332  7.000000000000001e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  47.02 
 
 		 338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  46.87 
 
 		 335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  45.37 
 
 		 357 aa  299  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  45.99 
 
 		 335 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  44.21 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  44.28 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  43.92 
 
 		 362 aa  285  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  41.19 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  44.14 
 
 		 391 aa  275  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  40.9 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  32.89 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.29 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 715 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.29 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.9 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  31.82 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  32 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  32 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  32 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  28.38 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  21.9 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  30 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  24.19 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.33 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0838  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  24.16 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.81 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  27.22 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  26.09 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.49 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  22.94 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  22.94 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.49 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  24.29 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  24.15 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.4 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  29.33 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.97 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  23.73 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  28.28 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  22.35 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  26.63 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  23.88 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.95 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  25.78 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  22.88 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  28.91 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 425 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  25.09 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  24.73 
 
 		 722 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 734 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  29.23 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  25.13 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 315 aa  53.5  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  23.24 
 
 		 369 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 393 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.47 
 
 		 438 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 		 350 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 		 353 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  24.35 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  25.65 
 
 		 344 aa  52.8  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>