More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1643 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 317 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.91 
 
 		 317 aa  590  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.38 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.75 
 
 		 315 aa  346  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.33 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.1 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  26.37 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.1 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  26.67 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  23.75 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  24.92 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  26.3 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  26.23 
 
 		 694 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  22.4 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.88 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  22.33 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 746 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.99 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  20.85 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.53 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.99 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  24.24 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.94 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.759181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.99 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  20.78 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.28 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.8 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.61 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  21.17 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  26.4 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  25.29 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  21.6 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.82 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.46 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  26.9 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  23.69 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  27.12 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.48 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  25.74 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.81 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  26.9 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  26.9 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  24.1 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.92 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.57 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  21.24 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.04 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  27.85 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  27.85 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  25.97 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  27.06 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  25.17 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 		 450 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  25 
 
 		 384 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  28.7 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.11 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  26.97 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>