More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1496 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1390  putative signal transduction histidine kinase  88.53 
 
 		 462 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1496  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 462 aa  939    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0938967  normal  0.650695 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4345  putative signal transduction histidine kinase  58.7 
 
 		 466 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.262209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0795  histidine kinase  33.33 
 
 		 494 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.782448  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1559  ATP-binding region, ATPase-like  31.77 
 
 		 469 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3277  histidine kinase  31.33 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389696  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1114  histidine kinase  27.32 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0404541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  29.69 
 
 		 683 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3762  histidine kinase  30.77 
 
 		 339 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.026612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  28.08 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  29.53 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  29.76 
 
 		 223 aa  87.8  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 468 aa  87.8  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  30.81 
 
 		 309 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  29.35 
 
 		 393 aa  86.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.88 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  31.16 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  32 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 795 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 795 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  30.59 
 
 		 686 aa  83.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  30.14 
 
 		 518 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  28.23 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 795 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  29.95 
 
 		 664 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  29.11 
 
 		 795 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  29.41 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  29.73 
 
 		 710 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  29.73 
 
 		 710 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  27.23 
 
 		 1226 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  29.49 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  24.52 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  28.69 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 682 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  24.73 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  27.8 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 594 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  30.1 
 
 		 337 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  26.85 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  31.45 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 1229 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 545 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  26.73 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  28.43 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  26.79 
 
 		 1101 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1440  histidine kinase  29.51 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  24.51 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 596 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  29.37 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.09 
 
 		 797 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 595 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  30.94 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  29.29 
 
 		 1033 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2634  ATPase domain-containing protein  24.46 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  29.41 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  26.69 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 585 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 598 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  30.86 
 
 		 598 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  26.91 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  30.52 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  31.09 
 
 		 799 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  27.23 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0044  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 560 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 610 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  31.96 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 692 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  23.87 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  36.56 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  26.73 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.246252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  27.41 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  25 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0181  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>