More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0136 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  100 
 
 		 274 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  58.82 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  56.2 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  49.27 
 
 		 281 aa  277  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  53.53 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  50.74 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  49.08 
 
 		 276 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  48.34 
 
 		 279 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  49.45 
 
 		 294 aa  271  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  51.31 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  55.47 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  55.47 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  49.07 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  47.97 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  46.56 
 
 		 285 aa  238  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  44.85 
 
 		 272 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.05 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  39.93 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  47.39 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  42.91 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  40.91 
 
 		 281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  39.49 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  44.69 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  39.5 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  38.71 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  45.28 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  42.59 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  36.73 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  33.84 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  31.64 
 
 		 434 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  34.62 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.55 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  33.62 
 
 		 273 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  36.52 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.16 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  29.54 
 
 		 351 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  32.07 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.73 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  32.23 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  32.7 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  28.31 
 
 		 284 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  28.83 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  31.88 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30.63 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  29.45 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  29.45 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  32.85 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.82 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  31.58 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  34.52 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  27.91 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  28.84 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  27.99 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  29.71 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  30.21 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  38.8 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  26.8 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.62 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  30.63 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  26.77 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  27.41 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  28.3 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  29.92 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  28.78 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  28.67 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  27.27 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  28.96 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  30.58 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.86 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  29.02 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  29.5 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.44 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  31.44 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  28.47 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  29.47 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  27.96 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.74 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.98 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.96 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  29.48 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  30.57 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  27.65 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6771  NmrA-like protein  53.62 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  27.74 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  28.21 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  31.9 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  24.21 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  27.24 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  25.27 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  29.18 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  29.18 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  28.67 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  30.6 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  24.76 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  24.76 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  24.76 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  36.31 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>