More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4750 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4750  histidine kinase  100 
 
 
670 aa  1343    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5422  histidine kinase  40.06 
 
 
685 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0504919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  32.63 
 
 
685 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
686 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
712 aa  236  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
807 aa  226  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4144  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
760 aa  217  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.02765  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
889 aa  217  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3167  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
758 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000450225  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
1646 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
705 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  37.02 
 
 
681 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
681 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
1651 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  33.1 
 
 
580 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
759 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0137592  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7023  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
763 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180026  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  38.89 
 
 
676 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  38.73 
 
 
676 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
683 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
682 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0010  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
764 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00266104  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5171  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
749 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00341574  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5688  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
749 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00115642  decreased coverage  0.000406473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
727 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
807 aa  210  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4548  histidine kinase  36.34 
 
 
749 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000713404  normal  0.70634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
704 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
702 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
651 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2366  sensor histidine kinase/response regulator  34.13 
 
 
768 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00256663  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
1036 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1137  sensor histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 
760 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2403  sensor histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 
760 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00669702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5512  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
746 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294754  normal  0.0542916 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2109  sensor histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 
767 aa  208  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00292967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
508 aa  208  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
622 aa  208  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1417  sensor histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 
767 aa  208  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000575152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
783 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3169  sensor histidine kinase/response regulator  34.43 
 
 
760 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
727 aa  207  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
681 aa  207  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1496  sensor histidine kinase/response regulator  34.13 
 
 
725 aa  207  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000109142  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.01 
 
 
1036 aa  207  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
727 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3282  sensor histidine kinase/response regulator  34.43 
 
 
760 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0788114  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4959  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
746 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00168647  normal  0.0243136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
943 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
732 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1215 aa  205  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
827 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
1089 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
707 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
762 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1631 aa  204  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  32.05 
 
 
716 aa  204  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
949 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
766 aa  203  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
660 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1330  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
717 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  34.47 
 
 
533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
845 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
1013 aa  201  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  35.7 
 
 
949 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  36.8 
 
 
701 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5284  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
717 aa  201  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  34.52 
 
 
691 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
673 aa  200  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  33.91 
 
 
533 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  36.6 
 
 
956 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  34.91 
 
 
507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
741 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
781 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
818 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  37 
 
 
678 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
1381 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
922 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1620  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.8 
 
 
927 aa  198  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  36.25 
 
 
646 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
691 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
701 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
640 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
742 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
740 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
783 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
721 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
812 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  33.6 
 
 
541 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  33.6 
 
 
541 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
822 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
727 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  35.6 
 
 
611 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  34.64 
 
 
783 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  35.6 
 
 
611 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
492 aa  197  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  33.58 
 
 
539 aa  197  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  35.6 
 
 
611 aa  197  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
977 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>