More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4222 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  100 
 
 
286 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 
257 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  34.5 
 
 
249 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.88 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  30.8 
 
 
237 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
247 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 
248 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.59 
 
 
266 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.55 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  32 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  30.26 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  31.72 
 
 
663 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  32.98 
 
 
637 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  29.15 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 
259 aa  82  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
246 aa  79  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  30.07 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  32 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  28.05 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  25.86 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  25.95 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.07 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
675 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  26.92 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  27.18 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  27.53 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  26.92 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  24.26 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  30.5 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  27.78 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.07 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.07 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.07 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  27.69 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.07 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.07 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  31.21 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.21 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  25.63 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25.64 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  32.11 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  28.43 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  28.43 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
249 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  27.98 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  28.04 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  28 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
244 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  24.57 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  40 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  24.78 
 
 
238 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  24.78 
 
 
238 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  24.86 
 
 
246 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  25.89 
 
 
246 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  36.27 
 
 
410 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  27.18 
 
 
256 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  26.56 
 
 
253 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
246 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  27.07 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 
264 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  26.16 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 
250 aa  62.4  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.11 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  28.06 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  28.06 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  29.85 
 
 
152 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  27.62 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  30.36 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  23.71 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  28.51 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  32.84 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>