More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0559 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  68.84 
 
 		 147 aa  197  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  63.89 
 
 		 187 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  65.73 
 
 		 158 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  63.77 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  58.09 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  55.32 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  53.68 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  55.74 
 
 		 177 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  50.76 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 209 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  54.76 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  49.66 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  51.11 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 171 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  53.21 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  51.04 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 167 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  47.11 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  40.31 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 165 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  47.42 
 
 		 290 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  44.57 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  36.72 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  43.36 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 150 aa  94.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  46 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  46 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  46 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 160 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  46 
 
 		 212 aa  93.6  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 163 aa  93.6  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 160 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 163 aa  93.2  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  36.76 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 179 aa  90.9  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  36.76 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  37.3 
 
 		 154 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  37.3 
 
 		 178 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  34.92 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  36.57 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 169 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 244 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  38.89 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  38.46 
 
 		 268 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  36.03 
 
 		 188 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  36.57 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  34.97 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 172 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 172 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  38.21 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5101  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 156 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  42.59 
 
 		 280 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  48.31 
 
 		 179 aa  86.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  36.22 
 
 		 186 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  43.01 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>