More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1995 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1995  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  100 
 
 		 453 aa  904    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  67.4 
 
 		 456 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1830  peptidase RseP  69.82 
 
 		 455 aa  597  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2688  peptidase RseP  67.25 
 
 		 458 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.214721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1765  putative membrane-associated zinc metalloprotease  65.72 
 
 		 458 aa  567  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2578  peptidase RseP  69.09 
 
 		 454 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.041357  normal  0.0436564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1445  putative membrane-associated zinc metalloprotease  65.35 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1230  membrane-associated zinc metalloprotease  69.09 
 
 		 454 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4941  membrane-associated zinc metalloprotease  59.78 
 
 		 456 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  56.72 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2843  membrane-associated zinc metalloprotease  50.1 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  47.83 
 
 		 454 aa  362  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  44.3 
 
 		 456 aa  359  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  46.45 
 
 		 461 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  45.34 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  47.3 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  45.94 
 
 		 463 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.55 
 
 		 462 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  45.55 
 
 		 462 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  45.61 
 
 		 455 aa  342  9e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46.32 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  45.83 
 
 		 456 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.75 
 
 		 455 aa  338  9e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46.2 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  43.35 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.57 
 
 		 455 aa  333  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  44.64 
 
 		 457 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.42 
 
 		 457 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.42 
 
 		 457 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  45.55 
 
 		 463 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  45.55 
 
 		 463 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.34 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.34 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  45.34 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.34 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  43.78 
 
 		 462 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  42.92 
 
 		 462 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  44.87 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  40.43 
 
 		 454 aa  303  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  38.4 
 
 		 469 aa  296  7e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.42 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  41.56 
 
 		 453 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.77 
 
 		 448 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  39.96 
 
 		 451 aa  289  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.26 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  40.43 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  40.65 
 
 		 450 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.52 
 
 		 456 aa  285  9e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.02 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  39.78 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  41.78 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.66 
 
 		 456 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  40.13 
 
 		 451 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  39.78 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.11 
 
 		 450 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.56 
 
 		 450 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.11 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40 
 
 		 450 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  38.88 
 
 		 456 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.72 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  40.43 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  36.33 
 
 		 452 aa  279  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.31 
 
 		 456 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.26 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.31 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  39.18 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.53 
 
 		 456 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  39.18 
 
 		 456 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.74 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  38.97 
 
 		 450 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  38.97 
 
 		 450 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  38.97 
 
 		 450 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  38.97 
 
 		 450 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  39.43 
 
 		 452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.43 
 
 		 452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.56 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  40.44 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  37.55 
 
 		 461 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.31 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  39.32 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  38.31 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  38.88 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  38.89 
 
 		 451 aa  270  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.01 
 
 		 449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  38.76 
 
 		 450 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.26 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  36.32 
 
 		 452 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  39 
 
 		 450 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  36.17 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  39 
 
 		 450 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  39.83 
 
 		 451 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  36.38 
 
 		 452 aa  266  7e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  38.78 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  38.78 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  38.78 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  38.78 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  37.77 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  39.61 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  38.78 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  39.61 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>