More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5278 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  70.82 
 
 		 784 aa  1164    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  75.13 
 
 		 794 aa  1228    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  100 
 
 		 783 aa  1623    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  70.82 
 
 		 784 aa  1162    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  71.47 
 
 		 783 aa  1180    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  71.08 
 
 		 784 aa  1169    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  65.03 
 
 		 788 aa  1064    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  76.25 
 
 		 788 aa  1260    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  80.26 
 
 		 780 aa  1330    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  70.82 
 
 		 784 aa  1162    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  57.09 
 
 		 769 aa  917    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  70.82 
 
 		 784 aa  1164    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  63.19 
 
 		 784 aa  994    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  70.82 
 
 		 784 aa  1164    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  61.87 
 
 		 775 aa  974    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  77.78 
 
 		 782 aa  1287    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  70.82 
 
 		 784 aa  1164    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  33.71 
 
 		 774 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  30.05 
 
 		 754 aa  287  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  35.55 
 
 		 418 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  45.89 
 
 		 333 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  45.89 
 
 		 333 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  34.93 
 
 		 425 aa  265  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  44.09 
 
 		 316 aa  250  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  45.4 
 
 		 321 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  43.77 
 
 		 333 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  40.99 
 
 		 322 aa  245  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  45 
 
 		 328 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.51 
 
 		 318 aa  240  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  41.35 
 
 		 316 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  45.7 
 
 		 315 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  41.35 
 
 		 316 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  41.27 
 
 		 319 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  40.88 
 
 		 323 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  38.46 
 
 		 326 aa  226  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  40.89 
 
 		 320 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  41.23 
 
 		 327 aa  224  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  41.14 
 
 		 320 aa  222  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  38.64 
 
 		 318 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  39.94 
 
 		 322 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  39.22 
 
 		 322 aa  217  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  39.22 
 
 		 316 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  38.49 
 
 		 323 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  39.93 
 
 		 315 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.25 
 
 		 317 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.29 
 
 		 316 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.81 
 
 		 322 aa  213  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  38.89 
 
 		 316 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  38.24 
 
 		 316 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  38.24 
 
 		 316 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  39.12 
 
 		 319 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.94 
 
 		 317 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  39.94 
 
 		 315 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  37.94 
 
 		 321 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  41.05 
 
 		 588 aa  208  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  39.94 
 
 		 315 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  39.94 
 
 		 315 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  38.24 
 
 		 320 aa  207  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  40.39 
 
 		 321 aa  207  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  38.87 
 
 		 319 aa  207  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  40.19 
 
 		 331 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  36.22 
 
 		 1069 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.18 
 
 		 316 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  37.62 
 
 		 321 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  38.76 
 
 		 321 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  37.62 
 
 		 321 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  38.18 
 
 		 321 aa  205  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  34.88 
 
 		 330 aa  204  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  37.3 
 
 		 321 aa  204  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  39.49 
 
 		 332 aa  204  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  39.3 
 
 		 657 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  41.18 
 
 		 365 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  39.81 
 
 		 319 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  38.05 
 
 		 320 aa  202  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  37.42 
 
 		 317 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.44 
 
 		 316 aa  201  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.85 
 
 		 315 aa  200  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  38.76 
 
 		 368 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  38.76 
 
 		 368 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  38.76 
 
 		 368 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  37.66 
 
 		 334 aa  198  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  36.5 
 
 		 325 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  40 
 
 		 320 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  38.91 
 
 		 321 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  35.53 
 
 		 1070 aa  197  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  39.06 
 
 		 323 aa  197  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  35.58 
 
 		 337 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  39.87 
 
 		 317 aa  197  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  37.22 
 
 		 352 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  37.69 
 
 		 319 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.48 
 
 		 331 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  39.49 
 
 		 330 aa  194  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  40.2 
 
 		 324 aa  194  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  37.04 
 
 		 321 aa  194  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.3 
 
 		 321 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  35.69 
 
 		 385 aa  193  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.87 
 
 		 426 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  37.61 
 
 		 326 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  38.28 
 
 		 320 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  38.62 
 
 		 351 aa  192  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>