69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4496 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  75.62 
 
 		 214 aa  307  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  37.2 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  29.17 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3737  hypothetical protein  28.79 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4946  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 227 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  28.04 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  31.51 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2703  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00115407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  29.49 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  32 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  29.21 
 
 		 239 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 223 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 261 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3785  hypothetical protein  31.08 
 
 		 207 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 199 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 218 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>