24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3785 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3785  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2752  TetR family transcriptional regulator  90.73 
 
 		 214 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3570  TetR family transcriptional regulator  71.77 
 
 		 219 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3575  TetR family transcriptional regulator  71.77 
 
 		 219 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3643  TetR family transcriptional regulator  71.77 
 
 		 219 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.664525  normal  0.339834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4324  hypothetical protein  56.54 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  33.8 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  42  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 220 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  31.08 
 
 		 203 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 263 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28.43 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>