199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2199 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  417  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  87.56 
 
 		 198 aa  370  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  89.06 
 
 		 199 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  79.06 
 
 		 194 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  79.29 
 
 		 196 aa  330  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  78.84 
 
 		 202 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.37 
 
 		 201 aa  315  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.13 
 
 		 192 aa  313  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.96 
 
 		 196 aa  311  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.09 
 
 		 207 aa  309  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.16 
 
 		 190 aa  307  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.07 
 
 		 193 aa  304  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.07 
 
 		 193 aa  303  8.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.13 
 
 		 192 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.4 
 
 		 202 aa  301  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  72.68 
 
 		 194 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  70.79 
 
 		 201 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  71.36 
 
 		 209 aa  298  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  70.15 
 
 		 201 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  73.06 
 
 		 192 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.58 
 
 		 192 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.54 
 
 		 192 aa  296  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.45 
 
 		 192 aa  295  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  73.4 
 
 		 191 aa  295  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.07 
 
 		 189 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  72.02 
 
 		 192 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.02 
 
 		 192 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.73 
 
 		 192 aa  291  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  72.02 
 
 		 192 aa  291  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.5 
 
 		 192 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  73.16 
 
 		 192 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.47 
 
 		 192 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.78 
 
 		 192 aa  278  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.78 
 
 		 192 aa  275  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.11 
 
 		 196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.02 
 
 		 192 aa  262  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.73 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.24 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.58 
 
 		 189 aa  254  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.71 
 
 		 195 aa  254  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.98 
 
 		 200 aa  252  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.83 
 
 		 235 aa  250  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.09 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.43 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.27 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.81 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.11 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.09 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.99 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  42.11 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  40.84 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.72 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  39.78 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.04 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  37.89 
 
 		 191 aa  140  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  35.71 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.53 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.53 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.77 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.53 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.47 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.06 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.37 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.32 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.34 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.21 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.35 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  27.17 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.32 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.57 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.14 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  30.34 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.66 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.93 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  25.15 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.36 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.46 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.68 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  24.56 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  30.37 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  26.95 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.81 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.56 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.98 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.05 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  32.48 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.49 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  33.66 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.36 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1021  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.66 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.85 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.13 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.59 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.47 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.67 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  28.9 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  31.62 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.77 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>