More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2427 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  86.04 
 
 		 444 aa  795    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  74.6 
 
 		 440 aa  691    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  86.96 
 
 		 439 aa  798    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  76.99 
 
 		 439 aa  715    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  70.84 
 
 		 440 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  70.16 
 
 		 443 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 439 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  89.95 
 
 		 439 aa  820    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 439 aa  902    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  69.93 
 
 		 444 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  91.1 
 
 		 439 aa  831    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  88.56 
 
 		 439 aa  808    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  71.46 
 
 		 444 aa  655    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  88.13 
 
 		 438 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  71.07 
 
 		 445 aa  655    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 		 441 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 		 441 aa  631  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  69.25 
 
 		 441 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  69.04 
 
 		 442 aa  622  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 		 441 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 		 450 aa  612  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  64.77 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 442 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  65.6 
 
 		 445 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  65.83 
 
 		 445 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 435 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  65.83 
 
 		 445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  65.23 
 
 		 442 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  65.38 
 
 		 498 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  65 
 
 		 442 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  64.32 
 
 		 440 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  64.32 
 
 		 440 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  64.32 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 441 aa  578  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  65.3 
 
 		 437 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 452 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 437 aa  559  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  63.8 
 
 		 438 aa  554  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 422 aa  478  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  61.95 
 
 		 568 aa  298  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 585 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  60.89 
 
 		 573 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  60.89 
 
 		 573 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 571 aa  295  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 576 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 581 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 571 aa  293  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 570 aa  293  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 573 aa  292  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 571 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 571 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 570 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 571 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  59.65 
 
 		 569 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02965  prolyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 572 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 571 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 566 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 572 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 581 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 564 aa  290  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 571 aa  290  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  61.06 
 
 		 576 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 569 aa  289  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 569 aa  289  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 570 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 570 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 570 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 570 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 571 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 572 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 572 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 584 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 572 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 570 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 572 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 		 580 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 572 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 578 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 571 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 571 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  59.29 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 578 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 578 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 578 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 578 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 572 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 578 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>