128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2115 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2115  response regulator receiver  100 
 
 		 130 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.223549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2330  response regulator  82.81 
 
 		 130 aa  213  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1483  response regulator/EAL domain protein  40.32 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0483  cyclic-di-GMP regulatory protein  30.4 
 
 		 406 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1293  EAL:response regulator receiver  34.96 
 
 		 453 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.532656  normal  0.518355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2139  CheY-like chemotaxis protein, response regulator receiver  26.56 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.109074  normal  0.326223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2580  putative diguanylate phosphodiesterase  26.67 
 
 		 413 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.465232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0908  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  28.93 
 
 		 405 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3209  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.770272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06170  sensory transduction protein kinase  25.2 
 
 		 380 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 759 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  32.28 
 
 		 678 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 642 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2289  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1309  response regulator receiver domain-containing protein  30.12 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 689 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  30.89 
 
 		 796 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2469  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  24.8 
 
 		 407 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.456711  normal  0.0660939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 817 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 644 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 727 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 727 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  41.43 
 
 		 228 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 727 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3039  diguanylate phosphodiesterase  28.93 
 
 		 395 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0303288  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1555  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  27.78 
 
 		 412 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27020  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.51 
 
 		 233 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  37.5 
 
 		 904 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  38.89 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 732 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 608 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1287 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4002  putative two-component response regulator  30.83 
 
 		 404 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.490249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  41.56 
 
 		 559 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4207  hypothetical protein  34.29 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  32.32 
 
 		 980 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2580  response regulator receiver domain-containing protein  37.88 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0651  response regulator receiver protein  38.37 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  35.23 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1649  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 479 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3779  hypothetical protein  34.29 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 641 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 759 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.3 
 
 		 778 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.3 
 
 		 778 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  25.6 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 823 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 1036 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1394  predicted protein  36.49 
 
 		 550 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1646  hypothetical protein  34.29 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3750  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  29.03 
 
 		 397 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  37.5 
 
 		 914 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  37.5 
 
 		 904 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  37.5 
 
 		 900 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  37.5 
 
 		 914 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6598  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.165096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0630  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.3 
 
 		 778 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.3 
 
 		 778 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.3 
 
 		 778 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2306  histidine kinase  36.99 
 
 		 479 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.808548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2152  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 273 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0525986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  30.12 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2461  response regulator receiver protein  32.63 
 
 		 132 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 226 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 457 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 226 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 226 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 238 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3531  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 159 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  32.18 
 
 		 262 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1202  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 270 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0510958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  29.13 
 
 		 534 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.71 
 
 		 631 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0692  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.370043  unclonable  0.00000000838432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  28.45 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 2099 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2487  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.88 
 
 		 735 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 218 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  28.92 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2171  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  35.2 
 
 		 408 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.189433  normal  0.293545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 654 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 1301 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 		 640 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1857 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  40.28 
 
 		 1351 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0640  two component LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2177  response regulator receiver protein  26.44 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.430622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  29.27 
 
 		 793 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  36.51 
 
 		 606 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  32.98 
 
 		 230 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0849  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1020  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  27.68 
 
 		 399 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2089  two component LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.954326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>