More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1921 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 133 aa  274  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  53.08 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  42.31 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  41.54 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  41.86 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  41.54 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  41.54 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36.57 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  39.69 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  33.83 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  33.85 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  28.91 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  32.58 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  33.08 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  33.08 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  29.13 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  36 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.13 
 
 		 360 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  31.06 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  27.27 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  30.95 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  35.83 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  35.2 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  36.44 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  33.61 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  36.44 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  33.6 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  30.77 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  33.6 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.81 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.81 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  28.12 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  32.8 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  33.87 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.84 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  27.69 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.25 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  25.93 
 
 		 434 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.25 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  33.87 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  33.86 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  30.08 
 
 		 352 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.03 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  32.28 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  32.31 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  31.2 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  28.91 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  31.5 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  30.3 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  32.03 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  32.03 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  32.03 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  29.69 
 
 		 347 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.03 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  30.3 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  33.06 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.31 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  32.81 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  27.48 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>