More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4615 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  55.79 
 
 		 1080 aa  1245    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  40.89 
 
 		 1248 aa  767    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4615  non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1082 aa  2207    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916541  hitchhiker  0.0000304153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  43.86 
 
 		 1075 aa  828    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  38.19 
 
 		 1291 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  41.1 
 
 		 1259 aa  745    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  36.78 
 
 		 1131 aa  290  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  36.56 
 
 		 918 aa  280  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  36.56 
 
 		 918 aa  280  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  36.56 
 
 		 918 aa  280  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  36.56 
 
 		 918 aa  280  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  36.8 
 
 		 918 aa  279  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  36.56 
 
 		 918 aa  279  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  36.56 
 
 		 918 aa  280  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  36.76 
 
 		 901 aa  278  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6039  SNF2 family DNA/RNA helicase  36.38 
 
 		 1010 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  37.24 
 
 		 1148 aa  277  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 		 918 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 		 918 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  37.25 
 
 		 1072 aa  273  9e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 		 898 aa  270  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  37.98 
 
 		 1019 aa  270  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  35.59 
 
 		 918 aa  269  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  35.78 
 
 		 918 aa  269  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1128 aa  269  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.1 
 
 		 1112 aa  267  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  36.47 
 
 		 1078 aa  265  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003242  helicase putative  35.11 
 
 		 1149 aa  265  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  36.92 
 
 		 917 aa  263  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  38.55 
 
 		 899 aa  259  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1359  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1146 aa  259  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 		 892 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  37.38 
 
 		 902 aa  258  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  36.57 
 
 		 1033 aa  257  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  35.73 
 
 		 1047 aa  255  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  36.64 
 
 		 1065 aa  254  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  33.66 
 
 		 1152 aa  254  8.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 		 1047 aa  254  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  35.51 
 
 		 1019 aa  253  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  35.01 
 
 		 1048 aa  253  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  36.2 
 
 		 988 aa  253  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1068 aa  253  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  36.68 
 
 		 1185 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  35.41 
 
 		 1067 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  35.6 
 
 		 1050 aa  251  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  36.77 
 
 		 1040 aa  251  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  36.78 
 
 		 1063 aa  249  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 1074 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 		 1021 aa  249  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  34.89 
 
 		 1007 aa  248  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  34.42 
 
 		 1175 aa  248  4e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  33.64 
 
 		 924 aa  247  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  35.06 
 
 		 621 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  33.01 
 
 		 1194 aa  246  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  33.39 
 
 		 931 aa  244  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.67 
 
 		 1099 aa  243  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.6 
 
 		 1048 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  34.76 
 
 		 1006 aa  243  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  33.92 
 
 		 886 aa  242  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  36 
 
 		 1531 aa  243  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.27 
 
 		 925 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  33.2 
 
 		 980 aa  241  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  35.13 
 
 		 949 aa  241  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.29 
 
 		 1068 aa  241  8e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 		 1112 aa  241  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  36.29 
 
 		 777 aa  240  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 		 1007 aa  240  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 		 933 aa  239  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  35.51 
 
 		 990 aa  238  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  36.12 
 
 		 958 aa  236  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  35.7 
 
 		 903 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 		 1028 aa  235  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 		 1091 aa  235  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 		 1068 aa  234  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  34.38 
 
 		 1013 aa  233  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  31.92 
 
 		 1068 aa  233  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 633 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.6 
 
 		 1029 aa  231  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  32.93 
 
 		 1071 aa  231  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3307  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.38 
 
 		 1033 aa  230  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.834499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 617 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  37.02 
 
 		 1100 aa  229  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  33.16 
 
 		 1088 aa  229  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 1069 aa  229  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 		 1055 aa  227  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  33.79 
 
 		 1087 aa  225  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.2 
 
 		 1139 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 		 895 aa  224  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  34.5 
 
 		 1178 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  32.22 
 
 		 1069 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 		 1108 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  31.83 
 
 		 1069 aa  223  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  36.51 
 
 		 872 aa  222  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.61 
 
 		 1104 aa  222  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 		 922 aa  221  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  35.03 
 
 		 1113 aa  221  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.03 
 
 		 1113 aa  221  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  33.21 
 
 		 914 aa  221  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  33.21 
 
 		 918 aa  221  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  35.08 
 
 		 1091 aa  220  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>