More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1385 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 415 aa  852    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  33.79 
 
 		 433 aa  245  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  33.94 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.94 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.35 
 
 		 424 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  39.33 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  26.11 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 859 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  26.23 
 
 		 378 aa  106  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  21.32 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 516 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  24.38 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  24.38 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  28.95 
 
 		 861 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 517 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 381 aa  90.1  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 		 389 aa  86.7  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 463 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  23.43 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.16 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 		 550 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 575 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 904 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  23.43 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.74 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0390  hypothetical protein  25.9 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17387  normal  0.017692 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  24.32 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.11 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.73 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  26.96 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  22.62 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>