48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1575 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  100 
 
 		 479 aa  983    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  44.73 
 
 		 717 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  53.58 
 
 		 329 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  41.22 
 
 		 711 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  52 
 
 		 329 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  43.35 
 
 		 709 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  50 
 
 		 330 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  49.19 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  44.12 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  43.27 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  42.86 
 
 		 340 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  46.09 
 
 		 254 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  43.08 
 
 		 340 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  42.14 
 
 		 343 aa  233  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  42.77 
 
 		 340 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  39.65 
 
 		 335 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  41.73 
 
 		 252 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  36.96 
 
 		 181 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  28.01 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  29.22 
 
 		 256 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  27.62 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  27.34 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  27.5 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  52.17 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  45.45 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  22.43 
 
 		 655 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  25.59 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  35.38 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  42.25 
 
 		 199 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  36.25 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  42.35 
 
 		 113 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  40.91 
 
 		 102 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  43.84 
 
 		 112 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  47.14 
 
 		 112 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  39.39 
 
 		 102 aa  53.5  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  30.1 
 
 		 106 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  42.47 
 
 		 112 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  36.67 
 
 		 126 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.13 
 
 		 806 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  34.85 
 
 		 160 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  23.49 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  35.53 
 
 		 326 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  36.49 
 
 		 130 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  21.41 
 
 		 884 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  24.66 
 
 		 580 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  28.95 
 
 		 116 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  22.66 
 
 		 305 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  23.24 
 
 		 344 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>